MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB18 chromosome

Total Repeats: 145047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007925	CAA	2	6	57	62	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007925	CGT	2	6	87	92	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007925	CGG	3	9	170	178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007925	CGAA	2	8	263	270	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007925	GC	3	6	353	358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007925	GAC	2	6	411	416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007925	CG	3	6	424	429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007925	GCG	2	6	434	439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007925	GCT	2	6	470	475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007925	CGA	2	6	532	537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007925	C	7	7	553	559	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_007925	AC	3	6	603	608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007925	CCG	2	6	641	646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_007925	GC	3	6	679	684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007925	GCC	2	6	692	697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_007925	CAT	2	6	715	720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007925	GGAT	2	8	849	856	25 %	25 %	50 %	0 %	90421529
18	NC_007925	ATT	2	6	930	935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90421529
19	NC_007925	GCT	2	6	951	956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421529
20	NC_007925	CGCC	2	8	1023	1030	0 %	0 %	25 %	75 %	90421529
21	NC_007925	GCCGC	2	10	1054	1063	0 %	0 %	40 %	60 %	90421529
22	NC_007925	GCC	2	6	1071	1076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421529
23	NC_007925	GC	3	6	1090	1095	0 %	0 %	50 %	50 %	90421529
24	NC_007925	CA	3	6	1120	1125	50 %	0 %	0 %	50 %	90421529
25	NC_007925	CGG	2	6	1135	1140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421529
26	NC_007925	CGC	2	6	1143	1148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421529
27	NC_007925	GCA	2	6	1211	1216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421529
28	NC_007925	GCC	2	6	1233	1238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421529
29	NC_007925	GCG	2	6	1239	1244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421529
30	NC_007925	CTG	2	6	1304	1309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421529
31	NC_007925	CCG	2	6	1365	1370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421529
32	NC_007925	TCG	2	6	1389	1394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421529
33	NC_007925	CGA	2	6	1462	1467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421529
34	NC_007925	GCAAG	2	10	1480	1489	40 %	0 %	40 %	20 %	90421529
35	NC_007925	GCCG	2	8	1535	1542	0 %	0 %	50 %	50 %	90421529
36	NC_007925	GGT	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90421529
37	NC_007925	CGC	2	6	1555	1560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421529
38	NC_007925	GCC	2	6	1567	1572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421529
39	NC_007925	CGA	2	6	1591	1596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421529
40	NC_007925	CGG	2	6	1618	1623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421529
41	NC_007925	TCG	3	9	1626	1634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421529
42	NC_007925	CTCG	2	8	1642	1649	0 %	25 %	25 %	50 %	90421529
43	NC_007925	CG	3	6	1697	1702	0 %	0 %	50 %	50 %	90421529
44	NC_007925	GTCC	2	8	1871	1878	0 %	25 %	25 %	50 %	90421529
45	NC_007925	GTG	2	6	1919	1924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90421529
46	NC_007925	CGC	2	6	1967	1972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421529
47	NC_007925	GACGCT	2	12	2020	2031	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	90421529
48	NC_007925	CGCT	2	8	2033	2040	0 %	25 %	25 %	50 %	90421529
49	NC_007925	CGG	2	6	2062	2067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421529
50	NC_007925	ACCAC	2	10	2073	2082	40 %	0 %	0 %	60 %	90421529
51	NC_007925	CGA	2	6	2140	2145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421529
52	NC_007925	CTG	2	6	2153	2158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421529
53	NC_007925	CGC	2	6	2216	2221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_007925	CG	3	6	2238	2243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007925	GGC	2	6	2260	2265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007925	GC	3	6	2264	2269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007925	GC	3	6	2319	2324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007925	TTGC	2	8	2370	2377	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007925	ACG	2	6	2397	2402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007925	ATG	2	6	2443	2448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007925	TGGATC	2	12	2449	2460	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_007925	CG	3	6	2493	2498	0 %	0 %	50 %	50 %	90421530
63	NC_007925	GCG	2	6	2540	2545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421530
64	NC_007925	TGC	3	9	2572	2580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421530
65	NC_007925	GC	3	6	2579	2584	0 %	0 %	50 %	50 %	90421530
66	NC_007925	CGAC	2	8	2611	2618	25 %	0 %	25 %	50 %	90421530
67	NC_007925	CGG	2	6	2647	2652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421530
68	NC_007925	CGG	2	6	2663	2668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421530
69	NC_007925	CCA	2	6	2671	2676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90421530
70	NC_007925	GC	3	6	2756	2761	0 %	0 %	50 %	50 %	90421530
71	NC_007925	CGC	2	6	2834	2839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421530
72	NC_007925	CCG	3	9	2869	2877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421530
73	NC_007925	GATC	2	8	2891	2898	25 %	25 %	25 %	25 %	90421530
74	NC_007925	CTA	2	6	2933	2938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421530
75	NC_007925	GCG	3	9	2976	2984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421530
76	NC_007925	GC	3	6	2990	2995	0 %	0 %	50 %	50 %	90421530
77	NC_007925	GCC	2	6	3051	3056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421530
78	NC_007925	GCC	2	6	3126	3131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421530
79	NC_007925	GTCG	2	8	3146	3153	0 %	25 %	50 %	25 %	90421530
80	NC_007925	GTG	2	6	3180	3185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90421530
81	NC_007925	AAC	2	6	3243	3248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90421530
82	NC_007925	GTC	2	6	3261	3266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421530
83	NC_007925	AAG	2	6	3270	3275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90421530
84	NC_007925	CG	3	6	3327	3332	0 %	0 %	50 %	50 %	90421530
85	NC_007925	CGC	2	6	3473	3478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421530
86	NC_007925	GC	3	6	3559	3564	0 %	0 %	50 %	50 %	90421530
87	NC_007925	CAG	2	6	3712	3717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007925	CTGACG	2	12	3792	3803	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	90421531
89	NC_007925	CG	3	6	3819	3824	0 %	0 %	50 %	50 %	90421531
90	NC_007925	GCG	2	6	3841	3846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421531
91	NC_007925	CGT	2	6	3848	3853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421531
92	NC_007925	TGG	2	6	3859	3864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90421531
93	NC_007925	TGT	2	6	3910	3915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90421531
94	NC_007925	GCGCC	2	10	3932	3941	0 %	0 %	40 %	60 %	90421531
95	NC_007925	CGA	2	6	3947	3952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421531
96	NC_007925	CCG	2	6	3991	3996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421531
97	NC_007925	GC	3	6	4006	4011	0 %	0 %	50 %	50 %	90421531
98	NC_007925	GCC	2	6	4056	4061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421531
99	NC_007925	TCGGC	2	10	4099	4108	0 %	20 %	40 %	40 %	90421531
100	NC_007925	GGC	3	9	4106	4114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421531
101	NC_007925	ATC	2	6	4123	4128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421531
102	NC_007925	GCG	3	9	4187	4195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421531
103	NC_007925	TTC	2	6	4197	4202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90421531
104	NC_007925	CAGC	2	8	4226	4233	25 %	0 %	25 %	50 %	90421531
105	NC_007925	CG	3	6	4240	4245	0 %	0 %	50 %	50 %	90421531
106	NC_007925	GCT	2	6	4283	4288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421531
107	NC_007925	AGC	2	6	4291	4296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421531
108	NC_007925	CTGG	2	8	4313	4320	0 %	25 %	50 %	25 %	90421531
109	NC_007925	CCG	2	6	4339	4344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421531
110	NC_007925	TCGCGG	2	12	4348	4359	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	90421531
111	NC_007925	GGC	2	6	4361	4366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421531
112	NC_007925	GCG	2	6	4372	4377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421531
113	NC_007925	CGC	2	6	4394	4399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421531
114	NC_007925	TGGA	2	8	4461	4468	25 %	25 %	50 %	0 %	90421531
115	NC_007925	CG	5	10	4536	4545	0 %	0 %	50 %	50 %	90421531
116	NC_007925	CGC	3	9	4547	4555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421531
117	NC_007925	GAA	2	6	4610	4615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90421531
118	NC_007925	GCT	2	6	4655	4660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421531
119	NC_007925	CGC	2	6	4714	4719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421531
120	NC_007925	CGA	2	6	4730	4735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421531
121	NC_007925	GGT	2	6	4736	4741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90421531
122	NC_007925	CGC	2	6	4761	4766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421531
123	NC_007925	GC	3	6	4798	4803	0 %	0 %	50 %	50 %	90421531
124	NC_007925	TCG	2	6	4837	4842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421531
125	NC_007925	GGC	2	6	4854	4859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421531
126	NC_007925	CGC	2	6	4891	4896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421531
127	NC_007925	CGG	2	6	4898	4903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421531
128	NC_007925	GCA	2	6	5027	5032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007925	TGG	2	6	5091	5096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007925	CCT	2	6	5116	5121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	90421532
131	NC_007925	CAG	2	6	5126	5131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421532
132	NC_007925	TCCA	2	8	5145	5152	25 %	25 %	0 %	50 %	90421532
133	NC_007925	GGC	2	6	5159	5164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421532
134	NC_007925	GCG	2	6	5194	5199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421532
135	NC_007925	CGGCC	2	10	5207	5216	0 %	0 %	40 %	60 %	90421532
136	NC_007925	ACG	2	6	5218	5223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421532
137	NC_007925	TCG	2	6	5229	5234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421532
138	NC_007925	CGCC	2	8	5279	5286	0 %	0 %	25 %	75 %	90421532
139	NC_007925	CGT	2	6	5318	5323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421532
140	NC_007925	CGGCA	2	10	5355	5364	20 %	0 %	40 %	40 %	90421532
141	NC_007925	CGT	2	6	5365	5370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421532
142	NC_007925	CAC	2	6	5411	5416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90421532
143	NC_007925	CGA	2	6	5426	5431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421532
144	NC_007925	CG	3	6	5444	5449	0 %	0 %	50 %	50 %	90421532
145	NC_007925	CCA	2	6	5455	5460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90421532
146	NC_007925	CAA	2	6	5477	5482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90421532
147	NC_007925	ACG	2	6	5530	5535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421532
148	NC_007925	CGAT	2	8	5536	5543	25 %	25 %	25 %	25 %	90421532
149	NC_007925	GCTACG	2	12	5545	5556	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	90421532
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151	NC_007925	CGG	3	9	5570	5578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421532
152	NC_007925	TCA	2	6	5638	5643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421532
153	NC_007925	CAA	2	6	5681	5686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90421532
154	NC_007925	CGA	2	6	5732	5737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421532
155	NC_007925	CGG	3	9	5774	5782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421532
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157	NC_007925	CCGGCG	2	12	5824	5835	0 %	0 %	50 %	50 %	90421532
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163	NC_007925	ACG	2	6	5989	5994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421532
164	NC_007925	TCA	2	6	5995	6000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421532
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167	NC_007925	ACG	2	6	6040	6045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421532
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172	NC_007925	CGA	2	6	6089	6094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421532
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177	NC_007925	A	6	6	6474	6479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_007925	CGA	2	6	9119	9124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421534
252	NC_007925	CCA	2	6	9290	9295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90421534
253	NC_007925	ACC	2	6	9385	9390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90421534
254	NC_007925	CAT	2	6	9419	9424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421534
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256	NC_007925	GCC	2	6	9516	9521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421534
257	NC_007925	TGA	2	6	9545	9550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90421534
258	NC_007925	GAC	2	6	9555	9560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421534
259	NC_007925	CAT	2	6	9591	9596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421534
260	NC_007925	GAC	2	6	9597	9602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421534
261	NC_007925	CGA	2	6	9611	9616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421534
262	NC_007925	GAA	2	6	9651	9656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90421534
263	NC_007925	CCAT	2	8	9709	9716	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
264	NC_007925	GAC	2	6	9724	9729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_007925	CG	3	6	9758	9763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
266	NC_007925	AGC	2	6	9790	9795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_007925	GCGA	2	8	9803	9810	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
268	NC_007925	CGC	2	6	9822	9827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
269	NC_007925	GCC	3	9	9909	9917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
270	NC_007925	CGG	2	6	9954	9959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_007925	TCT	2	6	10007	10012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90421535
272	NC_007925	TTC	2	6	10036	10041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90421535
273	NC_007925	CTT	2	6	10062	10067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90421535
274	NC_007925	CGT	2	6	10076	10081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421535
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281	NC_007925	ATG	2	6	10285	10290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90421535
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403	NC_007925	GGT	2	6	15123	15128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90421539
404	NC_007925	ATC	2	6	15160	15165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421539
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